Scorul de risc genetic îmbunătățit pentru diabetul de tip 1

fundal

Diagnosticul preclinic precoce al diabetului de tip 1 (T1D) poate permite prevenirea și reduce morbiditatea și costurile asociate asistenței medicale.

Testele pentru autoanticorpi sunt disponibile în prezent pentru sugarii care urmează să fie supuși screeningului pentru viitorul risc de apariție a T1D. Cu toate acestea, acestea sunt utilizate în studiile clinice. Acestea nu sunt considerate a fi rentabile pentru utilizare în practica de rutină. La adulții cu diabet emergent, tipul de diabet poate să nu fie neapărat evident din caracteristicile clinice. În unele cazuri, testele suplimentare, cum ar fi peptida C și screening-ul autoanticorpilor, nu sunt suficiente pentru un diagnostic fiabil, spun autorii unei publicații recente privind un nou scor de risc genetic [1].

T1D are o mare parte din componentele ereditare, dovadă fiind o rată de concordanță de până la 70% la gemeni și un risc de frate de 8%. Valoarea informativă a scorurilor de risc genetic variază în funcție de tipul și numărul de SNP (polimorfisme cu nucleotide unice) luate în considerare, de restricția datorată costurilor și dimensiunii eșantionului și metodelor de calcul al rezultatelor.

Riscul de T1D se datorează în mare parte variațiilor unor loci ai antigenului leucocitar uman (HLA) foarte puternic asociat. Scorurile de risc genetic (GRS) generate până acum pentru boala T1D nu conțin toate informațiile cunoscute despre loci non-HLA și în special despre loci de risc HLA.

Stabilirea obiectivelor

O echipă de oameni de știință condusă de Seth Sharp de la Institutul de Științe Biomedicale și Clinice de la Universitatea din Exeter Medical School din Exeter, Marea Britanie, și-a propus să transforme alelele HLA și interacțiunile lor, precum și recent descoperite loci non-HLA, într-un loc îmbunătățit T1D GRS, așa-numitul T1D GRS2, care urmează să fie integrat. Cercetătorii doresc să utilizeze noul scor pentru a identifica subtipurile de diabet și nou-născuții cu risc de T1D.

metodologie

Din 6.481 de pacienți și 9.247 de persoane de control din consorțiul de genetică pentru diabetul de tip 1, oamenii de știință au analizat variante ale loci genetice care au apărut atât în ​​regiunea HLA, cât și în întregul genom și au fost asociate cu T1D. Au modelat interacțiunile dintre variantele care au marcat haplotipuri HLA puternic asociate și au generat rapoarte de șanse pentru a crea T1D GRS2 îmbunătățit.

Utilizând date de la 387 de pacienți cu T1D și 11.885 de pacienți cu T2D de la Biobank din Marea Britanie, cercetătorii au validat T1D GRS2. De asemenea, au efectuat simulări pentru a compara performanța noului scor cu metodele tradiționale de diagnostic genetic și screening.

Rezultate

T1D GRS2 ia în considerare 67 de SNP-uri și interacțiunile dintre 18 combinații de haplotip HLA-DR-DQ. Scorul include acum mult mai multe haplotipuri DR-DQ, regiuni de reglementare din apropiere, mai multe alele de clasa I și alele HLA-DP care transmit susceptibilitate la T1D.

T1D GRS2 s-a dovedit a fi extrem de discriminatoriu pentru toate cazurile T1D (aria sub curba [ASC] 0,92; P <0,0001 față de scorurile mai vechi) și chiar mai eficient pentru T1D timpuriu (ASC 0,96).

În screeningul neonatal simulat, T1D GRS2 a fost aproape de două ori mai predictiv decât genotiparea HLA singură și cu 50% mai bună decât scorurile genetice actuale, care sunt utilizate pentru a prezice riscul de T1D în populația generală.

Concluzie

Un GRS T1D îmbunătățit, T1D GRS2, s-a dovedit a fi extrem de valoros în clasificarea diabetului adult și în îmbunătățirea screening-ului nou-născuților. Având în vedere rentabilitatea genotipării SNP, această abordare oferă un mare potențial de utilizare în clinică și în cercetarea T1D.

Autorii pot imagina utilizarea noului scor pentru a efectua screening-uri bazate pe populație și, ulterior, supune doar persoanelor cu un risc genetic ridicat la un test pentru prezența anticorpilor periodic.

Autorii studiului au primit subvenții de la diferite instituții necomerciale. Un coautor a primit finanțare din Marea Britanie. Programul instituțional de încredere instituțională al Consiliului de cercetare medicală cu scopul de a dezvolta un biocip 10-SNP pentru un test genetic pentru T1D în colaborare cu compania Randox.

!-- GDPR -->