Testarea genetică pe bază de ARN pentru cancerul ereditar

fundal

Astăzi, testarea genetică la nivel de ADN și-a găsit drumul în practica clinică. Identificarea unei predispoziții ereditare la diferite tipuri de cancer este posibilă și a deschis ușa către medicina personalizată, care a redus morbiditatea și mortalitatea asociată cancerului. Interpretarea datelor obținute prin testarea genetică la nivel de ADN rămâne o provocare până în prezent.

Se estimează că în aproximativ 15% până la 25% din variantele ADN asociate cu cancerul ereditar, îmbinarea genelor distruge ARN-ul funcțional. Aceste secvențe de ARN sunt definite ca variante de semnificație neclară (VUS) din cauza lipsei de funcționalitate.

Stabilirea obiectivelor

Scopul studiului a fost de a afla dacă efectuarea testelor genetice la nivel de ARN în plus față de testele genetice la nivel de ADN îmbunătățește diagnosticul și, astfel, gestionarea personalizată a riscului de cancer a pacienților cu predispoziții ereditare la diferite tipuri de cancer.

metodologie

Pacienții sau membrii familiei lor au fost eligibili pentru studiul de diagnostic dacă testele lor genetice la nivel de ADN au dat rezultate ambigue referitoare la gene ale cancerului ereditar de sân sau ovarian, sindromul Lynch sau cancerului gastric difuz ereditar. Un test genetic la nivelul ARN a fost efectuat pe acești pacienți folosind o probă de sânge.

În cele din urmă, au fost incluși în studiu pacienții sau membrii familiei lor la care au fost identificate mutații în genele germinale în testul genetic la nivelul ARN. S-a examinat apoi dacă managementul clinic al pacienților sau al familiilor s-a modificat ca urmare a constatărilor suplimentare la nivel de ARN. Pentru a răspunde acestei abordări, medicii curatori au trebuit să ia parte la un sondaj anonim.

O cohortă suplimentară de pacienți a fost investigată pentru a determina numărul de pacienți care ar beneficia de un test genetic la nivelul ARN. Aceasta a implicat un test genetic la nivelul ADN pentru predispoziția ereditară la cancer și a identificat variante genetice despre care se crede că influențează îmbinarea ARN-ului.

Rezultate

Interpretarea rezultatelor și a implicațiilor pentru managementul clinic

Din totalul de 909 de familii eligibile, 93 de familii (10,2%) au participat la un test genetic la nivelul ARN. Datele obținute în testul genetic au ajutat la o declarație clară în 49 din 56 de cazuri neclare (88%). Într-un total de 26 de cazuri (47%), informațiile utilizabile erau acum disponibile și 23 de cazuri (41%) au fost reclasificate ca benigne. Pe baza a 18 din 45 sondaje (40%) ale clinicienilor, s-a demonstrat că reclasificarea a ajustat managementul clinic la 8 din cei 18 pacienți (44%) și la un total de 14 din cele 18 familii.

Frecvența modificării splicingului ARN într-o cohortă de testare

Cohorta de pacienți examinați a constat din date de la 307.812 pacienți. La 7.265 de pacienți care au fost supuși unui test genetic bazat pe ADN, s-ar putea detecta variante patogene sau variante cu o semnificație neclară care ar putea influența potențialul de îmbinare a ARN. Prin urmare, se poate presupune că aproximativ fiecare al 43-lea pacient sau membru al familiei va beneficia de un test genetic bazat pe ARN. Acest calcul se bazează pe presupunerea că toată lumea este supusă testării genetice pentru cancerul ereditar.

Concluzie

Testele genetice pe bază de ARN efectuate în acest studiu au fost inițial capabile să identifice și să caracterizeze multe VUS într-o cohortă de pacienți și membri ai familiei care au fost examinați pentru predispoziții ereditare la cancer. În plus, s-a arătat că datele obținute în testul genetic bazat pe ARN ar ajuta la fiecare 43 de pacienți, deoarece rezultatul diagnosticului se modifică odată cu cunoștințele acumulate.